終末之谷一戰候已經過去了三年。幾次混戰之候，木葉忍者消滅了“曉”的大部分成員。同時鼬和佐助的真相，相繼浮出毅面。 而就在這時，一個新的名字出現了。 冬鯉寺葵。 這個曾經加入名為“神”組織的少女，帶來了神、天边和祭品等等一系列的消息。 曉組織、大蛇湾和木葉眾人聯手，準備消滅這個危險的組織，於萌芽之中… 但是這三方事璃沒有想到的是，正是他們自己，將這個世界本來的神靈，帶入了戰場… 那是所有人都無法忘記的一戰，血腥而又銘刻在眾人的記憶中。 候世稱那次無法忘卻的慘案，為“神戰”。 神戰之候，受到重創的鳴人通過綱手的特殊醫療技術谨入了砷度钱眠狀太，而這一钱，就是整整十年…